{"id":766,"date":"2024-07-19T11:25:07","date_gmt":"2024-07-19T09:25:07","guid":{"rendered":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/?page_id=766"},"modified":"2024-07-25T11:35:38","modified_gmt":"2024-07-25T09:35:38","slug":"wstep-do-informatyki-biomedycznej","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/","title":{"rendered":"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej"},"content":{"rendered":"

Wyk\u0142ad: (15 x 90minut)
\nCelem wyk\u0142adu jest zainteresowanie s\u0142uchaczy tymi elementami informatyki, kt\u00f3ra znajduj\u0105 praktyczne zastosowanie w medycynie i biologii. Przedstawione zagadnienia nie obejmuj\u0105 ca\u0142ego zakresu informatyki biomedycznej, s\u0105 raczej subiektywnym wyborem wyk\u0142adowc\u00f3w.
\nBloki tematyczne: Bioinformatyka (I), Obrazowanie biomedyczne (O), Wspomaganie diagnostyki medycznej (D), Biosygna\u0142y (S), Modelowanie (M)<\/p>\n

\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n
L.p.<\/td>\nProwadz\u0105cy<\/td>\nBlok<\/td>\nTemat wyk\u0142adu<\/td>\n<\/tr>\n
1<\/td>\nMK<\/td>\nI<\/td>\nOrganizacja zaj\u0119\u0107 oraz podstawy bioinformatyki (DNA, RNA, bia\u0142ka; geny, genom; zakres i zadania bioinformatyki) (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
2<\/td>\nMK<\/td>\nI<\/td>\nAlgorytmy dopasowania sekwencji (rodzaje dopasowania; metoda punktowa (ang. dot matrix), wykorzystanie programowania dynamicznego) (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
3<\/td>\nMK<\/td>\nI<\/td>\nWyszukiwanie podobnych sekwencji w bazach danych (algorytmy FASTA, BLAST) ,  przewidywanie gen\u00f3w (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
4<\/td>\nMK<\/td>\nI<\/td>\nMikromacierze DNA (ang. DNA microarrays), analiza ekspresji gen\u00f3w (grupowanie, klasyfikacja) (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
5<\/td>\nMK<\/td>\nO<\/td>\nMetody obrazowania (CT, MRI, US, PET, SPECT), algorytmy rekonstrukcji obraz\u00f3w (algorytm filtrowanej reprojekcji) (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
6<\/td>\nMK<\/td>\nO<\/td>\nCele przetwarzania i analizy obraz\u00f3w, podstawowe kroki procesu; przetwarzanie globalne (filtracja,…), ustawianie obraz\u00f3w (ang. image registration), wydobywanie struktury (detekcja, segmentacja), metody segmentacji  (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
7<\/td>\nMK<\/td>\nO<\/td>\nOcena ilo\u015bciowa – charakteryzacja struktur i obszar\u00f3w (cechy geometryczne, teksturalne,…), metody analizy tekstur (statystyczne, wyliczane na bazie macierzy jednorodnych ci\u0105g\u00f3w i wsp\u00f3\u0142wyst\u0119powania, …), klasyfikacja obraz\u00f3w<\/td>\n<\/tr>\n
8<\/td>\nAO<\/td>\nD<\/td>\nMetody stosowane we wspomaganiu diagnozowania medycznego: metody statystyczne, metody oparte na wiedzy; przyk\u0142ady modeli jako\u015bciowych i ilo\u015bciowych, miary jako\u015bci modeli decyzyjnych<\/td>\n<\/tr>\n
9<\/td>\nAO<\/td>\nD<\/td>\nWspomaganie diagnozy medycznej na podstawie modeli sieci bayesowskich. Reprezenacja wiedzy w sieci bayesowskiej, niezale\u017cno\u015b\u0107 warunkowa, wnioskowanie probabilistyczne. Przyk\u0142ad modelu sieci bayesowskiej do wspomagania diagnozowania chor\u00f3b w\u0105troby<\/td>\n<\/tr>\n
10<\/td>\nAO<\/td>\nD<\/td>\nCharakterystyka system\u00f3w wspomagania diagnozy medycznej: reprezentacja wiedzy i metody wnioskowania (m.in. MYCIN, INTERNIST-QMR, MUNIN, DIAVAL, HEPAR)<\/td>\n<\/tr>\n
11<\/td>\nMK<\/td>\nS<\/td>\nUrz\u0105dzenia rejestruj\u0105ce i rodzaje biosygna\u0142\u00f3w. Metody przetwarzania i analizy biosygna\u0142\u00f3w (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
12<\/td>\nMK<\/td>\nM<\/td>\nModelowanie w\u0105troby (jego uk\u0142adu krwiono\u015bnego) na potrzeby obrazowania. Wirtualna tomografia komputerowa<\/td>\n<\/tr>\n
13<\/td>\nMK<\/td>\nM\/O<\/td>\nWirtualna rzeczywisto\u015b\u0107 w biomedycynie (pdf<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n
14<\/td>\nMK<\/td>\nD<\/td>\nKlasyfikacja czu\u0142a na koszt (koszt b\u0142\u0119dnej klasyfikacji, koszt test\u00f3w)<\/td>\n<\/tr>\n
15<\/td>\nMK<\/td>\n*<\/td>\nEgzamin zerowy (pytania<\/a>)<\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n<\/div>\n

Pracownia specjalistyczna: (15 x 90minut)
\n<\/u>W ramach pracowni studenci przygotowuj\u0105 oprogramowanie (ew. grafik\u0119 prezentacyjn\u0105) zwi\u0105zan\u0105 z jednym z blok\u00f3w omawianych w ramach wyk\u0142adu. Praca indywidualna lub w grupach. W przypadku przygotowywania pracy magisterskiej zwi\u0105zanej tematycznie z Informatyk\u0105 Biomedyczn\u0105 mo\u017cliwa realizacja cz\u0119\u015bci pracy w ramach pracowni.<\/p>\n

Literatura [Czytelnia WI PB]:<\/p>\n

    \n
  1. J.H. van Bemmel, M.A. Musen, Handbook of Medical Informatics<\/em>, Springer, 1997.<\/li>\n
  2. E. Shortliffe, L. Perreault, G. Wiederhold, L. Fagan, Medical Informatics: Computer Applications in Health Care and Biomedicine<\/em>, Springer, 2001.<\/li>\n
  3. R. Tadeusiewicz, W. Wajs (red.), Informatyka Medyczna<\/em>, Wydawnictwo AGH, 1999.<\/li>\n
  4. R. Tadeusiewicz (red.), In\u017cynieria biomedyczna. Ksi\u0119ga wsp\u00f3\u0142czesnj wiedzy tajemnej w wersji przyst\u0119pnej i przyjemnej<\/em>, AGH Uczelniane Wydawnictwa Naukowo-Dydaktyczne, 2008.<\/li>\n
  5. K.W. Zieli\u0144ski, M. Strzelecki, Komputerowa analiza obrazu biomedycznego. Wst\u0119p do morfometrii i patologii ilo\u015bciowej<\/em>, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2002.<\/li>\n
  6. E. K\u0105cki, J.L. Kulikowski, A. Nowakowski, E. Waniewski (red.) Systemy komputerowe i teleinformatyczne w s\u0142u\u017cbie zdrowia<\/em>. Biocybernetyka i In\u017cynieria Biomedyczna 2000, Tom 7, Akademicka Oficyna Wydawnicza Exit, 2002.<\/li>\n
  7. L. Chmielewski, J.L. Kulikowski, A. Nowakowski (red.) Obrazowanie biomedyczne<\/em>. Biocybernetyka i In\u017cynieria Biomedyczna 2000, Tom 8, Akademicka Oficyna Wydawnicza Exit, 2003.<\/li>\n
  8. M. Ogiela, Strukturalne metody rozpoznawania obraz\u00f3w w kognitywnej analizie zobrazowa\u0144 medycznych<\/em>, Wydawnictwo AGH, 2004.<\/li>\n
  9. A. Baxevanis, B. Ouellette, Bioinformatyka. Podr\u0119cznik do analizy gen\u00f3w i bia\u0142ek<\/em>. PWN, 2004.<\/li>\n
  10. P. Baldi, S. Brunk, Bioinformatics: the Machine Learning Approach<\/em>, Second Ed., MIT Press, 2001.<\/li>\n
  11. P. Baldi, G. W. Hatfield, DNA Microarrays and Gene Expression: From Experiments to Data Analysis and Modeling<\/em>, Cambridge Univerity Press, 2002.<\/li>\n
  12. J. Moczko, L. Kramer, Cyfrowe metody przetwarzania sygna\u0142\u00f3w biomedycznych<\/em>, Wydawnictwo Naukowe UAM, 2001.<\/li>\n
  13. F. Hoppensteadt, C. Peskin, Modeling and Simulation in Medicine and the Life Sciences<\/em>, Second Ed, Springer, 2002.<\/li>\n
  14. E. Carson, C. Cobelli, Modelling Methodology for Physiology and Medicine<\/em>, Academic Press, 2001.<\/li>\n
  15. R. Cierniak, Tomografia komputerowa, Budowa urz\u0105dze\u0144 CT, Algorytmy rekonstrukcyjne<\/em>, AOW Exit, 2005.<\/li>\n
  16. M. Nieniewski, Segmentacja obraz\u00f3w cyfrowych. Metody segmentacji wododzia\u0142owej<\/em>, AOW Exit, 2005.<\/li>\n
  17. J. Cytowski, J. Gielecki, A. Gola, Cyfrowe przetwarzanie obraz\u00f3w medycznych. Algorytmy. Technologie. Zastosowania<\/em>, AOW Exit, 2008.<\/li>\n
  18. B. Preim, D. Bartz, Visualization in Medicine. Theory, Algorithms, and Applications<\/em>, Morgan Kaufmann, 2007.<\/li>\n
  19. P. Higgs, T. Attwood, Bioinformatyk i ewolucja molekularna<\/em>, WNT, 2008.<\/li>\n
  20. J. Xiong, Podstawy bioinformatyki<\/em>, WUW, 2009.<\/li>\n<\/ol>\n

    Internet:<\/p>\n

      \n
    1. Serwis „Technika w medycynie”<\/a>, Wydzia\u0142 ETI, Politechnika Gda\u0144ska<\/li>\n
    2. Dane obrazowe:  Visible Humans Project<\/a><\/li>\n
    3. Wyk\u0142ady A. Przelaskowskiego, Wydzia\u0142 EiTI, Politechnika Warszawska
      \n      Aparatura ultrasnograficzna<\/a>
      \n      Komputerowe wspomaganie obrazowej diagnostyki medycznej<\/a><\/li>\n
    4. ITK<\/a><\/li>\n
    5. ImageJ<\/a><\/li>\n
    6. P. Augustyniak, Przetwarzanie sygna\u0142\u00f3w elektrodiagnostycznych<\/a>, AGH Uczelniane Wydawnictwo Naukowo-Techniczne, 2001<\/li>\n
    7. R. Tadeusiewicz, Informatyka medyczna<\/a>, UMCS Lublin, 2011 <\/li>\n<\/ol>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

      Wyk\u0142ad: (15 x 90minut) Celem wyk\u0142adu jest zainteresowanie s\u0142uchaczy tymi elementami informatyki, kt\u00f3ra znajduj\u0105 praktyczne zastosowaniewi\u0119cej<\/a><\/p>\n","protected":false},"author":14,"featured_media":0,"parent":590,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"inline_featured_image":false,"ngg_post_thumbnail":0,"footnotes":""},"class_list":["post-766","page","type-page","status-publish","hentry"],"acf":[],"yoast_head":"\nWst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej<\/title>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"pl_PL\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Wyk\u0142ad: (15 x 90minut) Celem wyk\u0142adu jest zainteresowanie s\u0142uchaczy tymi elementami informatyki, kt\u00f3ra znajduj\u0105 praktyczne zastosowaniewi\u0119cej\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2024-07-25T09:35:38+00:00\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Szacowany czas czytania\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"5 minut\" \/>\n<script type=\"application\/ld+json\" class=\"yoast-schema-graph\">{\"@context\":\"https:\/\/schema.org\",\"@graph\":[{\"@type\":\"WebPage\",\"@id\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/\",\"url\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/\",\"name\":\"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej\",\"isPartOf\":{\"@id\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/#website\"},\"datePublished\":\"2024-07-19T09:25:07+00:00\",\"dateModified\":\"2024-07-25T09:35:38+00:00\",\"breadcrumb\":{\"@id\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/#breadcrumb\"},\"inLanguage\":\"pl-PL\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"ReadAction\",\"target\":[\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/\"]}]},{\"@type\":\"BreadcrumbList\",\"@id\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/#breadcrumb\",\"itemListElement\":[{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":1,\"name\":\"Strona g\u0142\u00f3wna\",\"item\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":2,\"name\":\"prof. dr hab. in\u017c. Marek Kr\u0119towski\",\"item\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":3,\"name\":\"Dydaktyka\",\"item\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/\"},{\"@type\":\"ListItem\",\"position\":4,\"name\":\"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej\"}]},{\"@type\":\"WebSite\",\"@id\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/#website\",\"url\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/\",\"name\":\"Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej\",\"description\":\"\",\"potentialAction\":[{\"@type\":\"SearchAction\",\"target\":{\"@type\":\"EntryPoint\",\"urlTemplate\":\"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/?s={search_term_string}\"},\"query-input\":{\"@type\":\"PropertyValueSpecification\",\"valueRequired\":true,\"valueName\":\"search_term_string\"}}],\"inLanguage\":\"pl-PL\"}]}<\/script>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/","og_locale":"pl_PL","og_type":"article","og_title":"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej","og_description":"Wyk\u0142ad: (15 x 90minut) Celem wyk\u0142adu jest zainteresowanie s\u0142uchaczy tymi elementami informatyki, kt\u00f3ra znajduj\u0105 praktyczne zastosowaniewi\u0119cej","og_url":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/","og_site_name":"Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej","article_modified_time":"2024-07-25T09:35:38+00:00","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Szacowany czas czytania":"5 minut"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/","url":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/","name":"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej - Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej","isPartOf":{"@id":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/#website"},"datePublished":"2024-07-19T09:25:07+00:00","dateModified":"2024-07-25T09:35:38+00:00","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/#breadcrumb"},"inLanguage":"pl-PL","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/wstep-do-informatyki-biomedycznej\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Strona g\u0142\u00f3wna","item":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"prof. dr hab. in\u017c. Marek Kr\u0119towski","item":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/"},{"@type":"ListItem","position":3,"name":"Dydaktyka","item":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/marek-kretowski\/dydaktyka\/"},{"@type":"ListItem","position":4,"name":"Wst\u0119p do informatyki biomedycznej"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/#website","url":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/","name":"Strony pracownik\u00f3w Wydzia\u0142u Informatyki Politechniki Bia\u0142ostockiej","description":"","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/?s={search_term_string}"},"query-input":{"@type":"PropertyValueSpecification","valueRequired":true,"valueName":"search_term_string"}}],"inLanguage":"pl-PL"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/766","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/users\/14"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=766"}],"version-history":[{"count":6,"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/766\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1517,"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/766\/revisions\/1517"}],"up":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/590"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/wi.pb.edu.pl\/p\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=766"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}